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勾配屋根などで、同じ階でも耐力壁の高さが変わる場合、引き抜き力算定のＨ（階高）を壁によって変えたい場合は、どのようにしたらよろしいでしょうか。（階高より高くしたい場合など）

耐力壁の高さが横架材間の内法寸法と異なる場合は、設定する面材耐力壁のプロパティ画面より”高さ係数β”を変更していただくよう、お願い致します。
高さ係数β＝面材高さの合計／横架材の内法寸法
※面材耐力壁プロパティの高さ係数βにマイナスが付いている場合は自動的に求めた値ですので、変更する場合はマイナスを取ってください。

ご質問では引抜力算定についてのみ言及されておりますが、壁倍率が変更されることで、壁量が変わりますので、ほぼ全ての検討に影響します。壁倍率はそのままで引抜力だけ変更することはできません。
壁倍率＝材料の壁倍率×（面材高さの合計／横架材の内法寸法）×壁倍率算出係数　で求めます。