STRDESIGN

構造計算を実行すると、屋根面総面積が分断前と後では面積集計結果がことなります。

屋根が正常に分割されていない場合に出る警告メッセージです。大きく値が違わなければ特に問題はないと思われます。
確認方法としては、[計算・出力の内容]で「荷重図」の出力を「する」にし、構造計算書の最後にある「参考図　荷重図」の屋根荷重図を参照してください。